Tidyr：pivot_wider错误：无法将<double>转换为<list>

如何解决Tidyr：pivot_wider错误：无法将<double>转换为<list>

我有一个数据框，其中列出了跨多个调查样地的物种观测结果（数据为here）。我正在尝试使用tidyr的pivot_wider将丰度数据分布在几列中，新列是每个观察到的物种。这是我要用来执行此操作的代码行：

>>> start = 50
>>> step = 75
>>> end = 550
>>> np.stack((np.arange(0,end - start,step),np.arange(start,end,step)),axis=1)
array([[  0,50],[ 75,125],[150,200],[225,275],[300,350],[375,425],[450,500]])

但是，这给了我两条错误消息：

data %>% pivot_wider(names_from = Species,values_from = Total.Abundance,values_fill = 0)

我不确定问题出在哪里，因为这对于其他（看起来）与此数据帧相同的其他数据帧来说效果很好。我尝试谷歌搜索第一条错误消息，但无法找到导致该错误的原因-我不知道double R试图将其转换为列表的原因，也不知道为什么它试图将其转换为列表。 Total.Abundance列应该是整数，但是我想知道它是否是双精度数据类型？ 根据我的发现，当数据框中有相同的行时，会出现第二条错误消息。但是，当我将语句修改为

时，错误仍然存​​在

Error: Can't convert <double> to <list>.
Values are not uniquely identified; output will contain list-cols.

我本以为会删除重复的行。 任何帮助将不胜感激！

解决方法

根据我的评论，您数据中的重复项无法被unique()或dplyr，distinct()删除：

dat %>%
  distinct() %>%
  group_by(Plot.ID,Species) %>%
  count()
#   Plot.ID Species                  n
#     <dbl> <chr>                <int>
# 1       1 Calliopius               1
# 2       1 Idotea                   2
# 3       1 Lacuna vincta            2
# 4       1 Mitrella lunata          2
# 5       1 Podoceropsis nitida      1
# 6       1 Unk. Amphipod            1
# 7       1 Unk. Bivalve             1
# 8       2 Calliopius               1
# 9       2 Caprella penantis        1
#10       2 Corophium insidiosum     1

需要找出为什么会有这样的重复项并进行调和，例如将它们加起来。问题可能出在解决编码错误的数据上，在这种情况下，求和不一定适用。或者，也许说您对同一图样进行了两次采样，您想用均值而不是总和来归一化与采样工作量，或者可能需要额外的列来表示采样工作量。但是，这很完美：

dat %>%
  group_by(Plot.ID,Species) %>%
  summarise(abundance = sum(Total.Abundance)) %>%
  tidyr::pivot_wider(names_from = Species,values_from = abundance,values_fill = 0)