尝试从GitHub安装软件包时出错

如何解决尝试从GitHub安装软件包时出错

我正在尝试从自己的存储库中安装软件包,以测试功能是否正常运行。到存储库的链接在这里:https://github.com/hharder74/SampleMeansII。当我尝试使用以下代码进行安装时:

devtools::install_github("hharder74/SampleMeansII")

我收到以下错误:

Error: Failed to install 'unknown package' from GitHub: HTTP error 404. Not Found Did you spell the repo owner (`hharder74`) and repo name (`SampleMeansII`) correctly? - If spelling is correct,check that you have the required permissions to access the repo.

我真的很困惑这个错误的来源。这是我第一次尝试将软件包上传到GitHub,我只是想在将软件包交给老师之前先检查是否可以安装该软件包。如果有人需要,下面是一些代码来测试功能:

vec <- runif(100)

sample_mean(vec,50)
many_sample_means(vec,reps = 10,n = 50)
sample_means_ns(vec,ns = c(5,50,500))

解决方法

您尚未创建包。您刚刚创建了一些带有R代码的文件。 R包具有非常特殊的结构,其中包含诸如Description文件和NAMESPACE文件之类的内容。从理论上讲,您可以自己创建这些文件,但是使用devtools::createroxygen之类的文件来创建它们通常会更容易。或者,如果您使用的是RStudio,则可以使用这些文件的默认版本创建一个新的R Package项目。

要添加说明文件,请尝试运行

usethis::use_description()

这将填写您可以更改的默认值。

然后,您将需要创建一个NAMESPACE文件。如果您只想让您在R文件中定义的所有功能都可以在pacakge之外使用,则只需输入

exportPattern("^[[:alpha:]]+")

在该文件中,那应该可以工作。

您也可以考虑遵循http://r-pkgs.had.co.nz/package.htmlhttps://swcarpentry.github.io/r-novice-inflammation/08-making-packages-R/之类的指南,以更好地了解如何创建软件包。

一旦您的存储库看起来像一个正确的R软件包,则可以使用devtools::install_github进行安装。

请注意,github可用于跟踪对任何类型文件的更改。您可以在R脚本中执行分析,以跟踪其更改并将其保存在github上,但是将该分析脚本转换为包可能没有意义。通常,当您想在不同项目中重用功能或数据时,可以制作软件包,然后这些项目可以安装和加载软件包。因此,并非所有R代码都生活在R软件包中,但是devtools::install_github仅可用于安装实际的软件包。

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