如何解决使用Apply和for循环绑定
我正在使用 apply 和 abind 创建一个数据框，其中包含来自三个相似数据框的所有单个值的平均值。我想循环这段代码，唯一改变的地方是我使用的仪器名称（CAI.600，Thermo.1等）。
这是我到目前为止所拥有的：
FIDs <- c('CAI.600','Thermo.1')
for (Instrument in FIDs) {
A.avg <- apply(abind::abind(paste0('FID.Eval.A.1.',Instrument),paste0('FID.Eval.A.2.',paste0('FID.Eval.A.3.',along = 3),1:2,mean)
assign(paste0('FID.Eval.A.',A.avg)
}
所有df看起来都与此类似（相同的行数和列数）：
> FID.Eval.A.1.CAI.600
FTIR O2 H2O CAI.600 CAI.600.bias
1 84.98 20.90 0.06 254.96 0.01
2 49.98 20.90 0.09 150.09 0.09
3 25.00 20.94 0.09 75.24 0.31
4 85.03 10.00 0.08 251.99 -1.22
5 50.03 10.00 0.09 148.51 -1.06
6 24.99 10.00 0.07 74.00 -1.27
7 84.99 0.10 0.06 246.99 -3.13
8 50.03 0.10 0.14 146.50 -2.39
9 24.96 0.10 0.10 72.97 -2.55
> FID.Eval.A.2.CAI.600
FTIR O2 H2O CAI.600 CAI.600.bias
1 85.45 21.37 0.53 255.43 0.48
2 50.45 21.37 0.56 150.56 0.56
3 25.47 21.41 0.56 75.71 0.78
4 85.50 10.47 0.55 252.46 -0.75
5 50.50 10.47 0.56 148.98 -0.59
6 25.46 10.47 0.54 74.47 -0.80
7 85.46 0.57 0.53 247.46 -2.66
8 50.50 0.57 0.61 146.97 -1.92
9 25.43 0.57 0.57 73.44 -2.08
> FID.Eval.A.3.CAI.600
FTIR O2 H2O CAI.600 CAI.600.bias
1 85.32 21.24 0.40 255.30 0.35
2 50.32 21.24 0.43 150.43 0.43
3 25.34 21.28 0.43 75.58 0.65
4 85.37 10.34 0.42 252.33 -0.88
5 50.37 10.34 0.43 148.85 -0.72
6 25.33 10.34 0.41 74.34 -0.93
7 85.33 0.44 0.40 247.33 -2.79
8 50.37 0.44 0.48 146.84 -2.05
9 25.30 0.44 0.44 73.31 -2.21
我以太收到一条错误消息，指出“必须在0到2之间”，或者当我调整时，我得到一条警告，指出“参数不是数字或逻辑：返回NA”。
我是否应该使用for循环以外的其他东西。
当我不使用 abind 而运行 for loop 时，最终结果如下：
## Average of repeat tests
FID.Eval.A.CAI.600 <- apply(abind::abind(FID.Eval.A.1.CAI.600,FID.Eval.A.2.CAI.600,FID.Eval.A.3.CAI.600,mean)
FID.Eval.A.CAI.600 <- as.data.frame(FID.Eval.A.CAI.600)
> FID.Eval.A.CAI.600
FTIR O2 H2O CAI.600 CAI.600.bias
1 85.25 21.17 0.33 255.23 0.28
2 50.25 21.17 0.36 150.36 0.36
3 25.27 21.21 0.36 75.51 0.58
4 85.30 10.27 0.35 252.26 -0.95
5 50.30 10.27 0.36 148.78 -0.79
6 25.26 10.27 0.34 74.27 -1.00
7 85.26 0.37 0.33 247.26 -2.86
8 50.30 0.37 0.41 146.77 -2.12
9 25.23 0.37 0.37 73.24 -2.28
“ FID.Eval.A.CAI.600”显示三个df中每个值的平均值。
解决方法
要解决即时问题，请使用get()通过字符引用返回对象。到目前为止，您的paste0调用将仅返回字符串，而不返回实际对象。
abind::abind(get(paste0('FID.Eval.A.1.',Instrument),envir=.GlobalEnv),get(paste0('FID.Eval.A.2.',get(paste0('FID.Eval.A.3.',along = 3)
实际上，对于更动态的解决方案，请考虑mget以名称模式返回所有对象，而无需对三个对象中的每个对象进行硬编码。
此外，在R中，最好尽可能避免使用assign。相反，请考虑使用功能分配构建许多对象的一个列表，并避免用许多单独的对象充斥全局环境。下面使用sapply进行迭代，以建立一个命名平均矩阵列表。
FIDs <- c('CAI.600','Thermo.1')
mat_list <- sapply(FIDs,function(Instrument) {
FIDs_list <- mget(ls(pattern=Instrument,envir=.GlobalEnv)
FIDs_arry <- do.call(abind::abind,c(FIDs_list,along=length(FIDs_list)))
return(apply(FIDS_arry,1:2,mean))
},simplify = FALSE)
# OUTPUT ITEMS
mat_list$CAI.600
mat_list$Thermo.1
甚至更新名称也可以满足您的原始需求。
names(mat_list) <- paste0("FID.Eval.A.",names(mat_list))
mat_list$FID.Eval.A.CAI.600
mat_list$FID.Eval.A.Thermo.1
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