如何解决如何绘制matplotlib.axes列表?
我正在使用一些返回matplotlib.axes对象的代码。我使用的代码是https://github.com/pblischak/HyDe/blob/master/phyde/visualize/viz.py上的def_density()函数。 在一个循环中,我打开一个数据文件,解析每一行,输入一些数据,创建一个matplotlib.axes对象(使用seaborn.kdeplot()方法),提取图像,然后将图像写入文件。效果很好,但每个文件行只剩下一张图像。我真正想做的是收集所有图像,将它们放在网格中,然后仅创建一个图像。我不知道我会提前拥有多少张图像(尽管我当然可以先计算行数,然后再使用该信息在文件上重复)。
这是我的代码
import phyde as hd
import os
import sys
bootfile = sys.argv[1]
triplesfile = sys.argv[2]
boot = hd.Bootstrap(bootfile)
triples=open(triplesfile,"r")
next(triples)
for line in triples:
triple = line.split()
p1=triple[0]
p2=triple[1]
p3=triple[2]
title="Bootstrap Dist. of Gamma for "+p1+","+p2+",and "+p3
image= hd.viz.density(boot,'Gamma',p1,p2,p3,title=title,xlab="Gamma",ylab="Density")
fig = image.get_figure()
figname="density_"+p1+"_"+p2+"_"+p3+".png"
fig.savefig(figname)
我的问题是,如果我说要在5 x 4网格中列出20个地块,该怎么做?我使用在这里找到的示例尝试了多种方法,但是似乎没有任何效果(plt.subplots()是我玩过的东西)。任何建议都将受到欢迎!
解决方法
要将单个密度图放置在网格中,必须将其传递给网格中的其中一个轴作为绘图功能,但是phyde.viz.density
(位于seaborn.kdeplot
上非常薄的一层不能重新使用现有axes
的条款。
因此,您必须定义¹您的薄层,需要一个预先存在的axes
def density2(ax,boot_obj,attr,p1,hyb,p2,title="",xlab="",ylab="",shade=True,color='b'):
from numpy import array
from seaborn import kdeplot,set_style
set_style("white")
kdeplot(array(boot_obj(attr,p2)),shade=shade,color=color,ax=ax)
# #####
ax.set(ylabel=ylab,xlabel=xlab,title=title)
,然后使用plt.subplots
将单个图布置在一个网格中(您在问题中提到5×4)
...
fig,axes = plt.subplots(5,4,constrained_layout=True)
for row in axes:
for ax in row:
line = next(triples)
...
density2(ax,boot,'Gamma',p3,title=title,xlab="Gamma",ylab="Density")
fig.savefig('You have to decide a title for the collection of plots')
1 :(当然)我定义的功能是改编自https://hybridization-detection.readthedocs.io/_modules/phyde/visualize/viz.html
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