如何解决合并具有特定列长度不同长度的多个表
我要按列V1
合并的文件夹中有多个数据表。如果在数据帧中找不到ID(V1),则应在数据表中为该特定ID保留NA或0。
我已经尝试过这种解决方案,但是它要求所有ID都在所有数据帧中。
setwd("../")
file_list = list.files(pattern="*.csv")
datalist = lapply(file_list,function(x){
dat = read.csv(file=x,header=F,sep = "\t")
names(dat)[2] = x
return(dat)
})
library(plyr); library(dplyr)
joined <- join_all(dfs = datalist,by = "V1",type ="full" )
示例输入:
> head(a)
V1 V2
1 oni-miR-8159_MIMAT0042837_Oreochromis_niloticus_miR-8159 990663
2 oni-miR-148-3p_MIMAT0042824_Oreochromis_niloticus_miR-148-3p 205000
3 oni-miR-122_MIMAT0042727_Oreochromis_niloticus_miR-122 164163
4 oni-let-7a_MIMAT0042659_Oreochromis_niloticus_let-7a 58769
5 oni-let-7a_MIMAT0042659_Oreochromis_niloticus_let-7a 58769
6 oni-let-7a_MIMAT0042659_Oreochromis_niloticus_let-7a 58554
> head(b)
V1 V2
1 oni-miR-122_MIMAT0042727_Oreochromis_niloticus_miR-122 224691
2 oni-miR-143_MIMAT0042647_Oreochromis_niloticus_miR-143 173663
3 oni-miR-26a_MIMAT0042651_Oreochromis_niloticus_miR-26a 111156
4 oni-miR-26a_MIMAT0042651_Oreochromis_niloticus_miR-26a 110569
5 oni-miR-26a_MIMAT0042651_Oreochromis_niloticus_miR-26a 110534
6 oni-miR-192_MIMAT0042644_Oreochromis_niloticus_miR-192 80646
> head(c)
V1 V2
1 oni-miR-122_MIMAT0042727_Oreochromis_niloticus_miR-122 176167
2 oni-miR-145_MIMAT0043395_Oreochromis_niloticus_miR-145 96204
3 oni-let-7a_MIMAT0042659_Oreochromis_niloticus_let-7a 71627
4 oni-let-7a_MIMAT0042659_Oreochromis_niloticus_let-7a 71627
5 oni-let-7a_MIMAT0042659_Oreochromis_niloticus_let-7a 71568
6 oni-let-7a_MIMAT0042659_Oreochromis_niloticus_let-7a 71563
版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。