计算共定位对象

如何解决计算共定位对象

我正在尝试编写代码,以自动计算图中的圆形对象。对我来说,我想计算包含(例如)蓝色,红色和蓝色+红色染色的圆圈(图像中的核)的数量。到目前为止,我已经获得了一个计算所有蓝色和所有红色圆圈的代码。我很难编写/修改代码以获取蓝色和红色的圆圈(共定位)。我已经在Google Colab上撰写了这篇文章。这是输出一个.csv文件的代码,该文件在用户上传的图片中的文件名计数为红色,绿色和蓝色圆圈。

from google.colab import files
from PIL import Image
import matplotlib.pyplot as plt
import cv2
import numpy as np
import pandas as pd

object_count = dict()
image_list = []

#### Object Counter Class
class ObjectCounter:
    
    def count(self):
        genotype = input('Genotype: ') 
        nImages = input('Number of images to quantify: ')
        a = 0

        while a < int(nImages):
          uploaded = files.upload()
          fileName = input('File name: ')
          image_list.append(fileName)

          low_intensity = int(input('Lower intensity: '))

          img = cv2.imread(fileName)
          img = cv2.cvtColor(img,cv2.COLOR_BGR2RGB)
          plt.imshow(img)
          plt.show()

          r,g,b = cv2.split(img)

          colors = ['Red','Green','Blue']
          channels = [r,b]
          x = 0

          for i in channels:
            seed_pt = (20,20)
            fill_color = 0
            mask = np.zeros_like(i)
            kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_RECT,(3,3))

            for th in range(low_intensity,255):
              prev_mask = mask.copy()
              mask = cv2.threshold(i,th,255,cv2.THRESH_BINARY)[1]
              mask = cv2.floodFill(mask,None,seed_pt,fill_color)[1]
              mask = cv2.bitwise_or(mask,prev_mask)
              mask = cv2.morphologyEx(mask,cv2.MORPH_OPEN,kernel)

            plt.imshow(mask)
            plt.show()

            n_centers = cv2.connectedComponents(mask)[0] - 1
            print('There are ' + str(n_centers) + ' objects in the image.')

            if colors[x] in object_count:
              object_count[colors[x]].append(n_centers)
            
            else:
              object_count[colors[x]] = [n_centers]
            
            x = x + 1
          
          df1 = pd.DataFrame(image_list,columns=['File Name'])         
          df2 = pd.DataFrame.from_dict(object_count)

          a = a + 1
        
        # Save the final counting data
        data = pd.concat([df1,df2],axis=1)
        print(data)

        output_fileName = input('Output .csv File Name: ')
        data.to_csv(output_fileName)
        files.download(output_fileName)

## Main Function 
countObj = ObjectCounter()
countObj.count()

这是一个示例图像,可用于测试代码。点击here

有人可以帮助我更新/改进此代码,以同时获得蓝色和红色的圆圈数吗?

预先感谢

Kasun

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。

相关推荐


依赖报错 idea导入项目后依赖报错,解决方案:https://blog.csdn.net/weixin_42420249/article/details/81191861 依赖版本报错:更换其他版本 无法下载依赖可参考:https://blog.csdn.net/weixin_42628809/a
错误1:代码生成器依赖和mybatis依赖冲突 启动项目时报错如下 2021-12-03 13:33:33.927 ERROR 7228 [ main] o.s.b.d.LoggingFailureAnalysisReporter : *************************** APPL
错误1:gradle项目控制台输出为乱码 # 解决方案:https://blog.csdn.net/weixin_43501566/article/details/112482302 # 在gradle-wrapper.properties 添加以下内容 org.gradle.jvmargs=-Df
错误还原:在查询的过程中,传入的workType为0时,该条件不起作用 &lt;select id=&quot;xxx&quot;&gt; SELECT di.id, di.name, di.work_type, di.updated... &lt;where&gt; &lt;if test=&qu
报错如下,gcc版本太低 ^ server.c:5346:31: 错误:‘struct redisServer’没有名为‘server_cpulist’的成员 redisSetCpuAffinity(server.server_cpulist); ^ server.c: 在函数‘hasActiveC
解决方案1 1、改项目中.idea/workspace.xml配置文件,增加dynamic.classpath参数 2、搜索PropertiesComponent,添加如下 &lt;property name=&quot;dynamic.classpath&quot; value=&quot;tru
删除根组件app.vue中的默认代码后报错:Module Error (from ./node_modules/eslint-loader/index.js): 解决方案:关闭ESlint代码检测,在项目根目录创建vue.config.js,在文件中添加 module.exports = { lin
查看spark默认的python版本 [root@master day27]# pyspark /home/software/spark-2.3.4-bin-hadoop2.7/conf/spark-env.sh: line 2: /usr/local/hadoop/bin/hadoop: No s
使用本地python环境可以成功执行 import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt # 设置字体 plt.rcParams[&#39;font.sans-serif&#39;] = [&#39;SimHei&#39;] # 能正确显示负号 p
错误1:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误还原:controller层有一个接口,访问该接口时报错:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误原因:没有接收到前端传入的参数,修改为如下 参考 错误2:cannot r
错误1:启动docker镜像时报错:Error response from daemon: driver failed programming external connectivity on endpoint quirky_allen 解决方法:重启docker -&gt; systemctl r
错误1:private field ‘xxx‘ is never assigned 按Altʾnter快捷键,选择第2项 参考:https://blog.csdn.net/shi_hong_fei_hei/article/details/88814070 错误2:启动时报错,不能找到主启动类 #
报错如下,通过源不能下载,最后警告pip需升级版本 Requirement already satisfied: pip in c:\users\ychen\appdata\local\programs\python\python310\lib\site-packages (22.0.4) Coll
错误1:maven打包报错 错误还原:使用maven打包项目时报错如下 [ERROR] Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-resources-plugin:3.2.0:resources (default-resources)
错误1:服务调用时报错 服务消费者模块assess通过openFeign调用服务提供者模块hires 如下为服务提供者模块hires的控制层接口 @RestController @RequestMapping(&quot;/hires&quot;) public class FeignControl
错误1:运行项目后报如下错误 解决方案 报错2:Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-compiler-plugin:3.8.1:compile (default-compile) on project sb 解决方案:在pom.
参考 错误原因 过滤器或拦截器在生效时,redisTemplate还没有注入 解决方案:在注入容器时就生效 @Component //项目运行时就注入Spring容器 public class RedisBean { @Resource private RedisTemplate&lt;String
使用vite构建项目报错 C:\Users\ychen\work&gt;npm init @vitejs/app @vitejs/create-app is deprecated, use npm init vite instead C:\Users\ychen\AppData\Local\npm-