使用#include <vector>无法检查R包

如何解决使用#include <vector>无法检查R包

我正在用C ++构建R的软件包。如何在代码中包含库？例如，如果我使用#include <vector>向量，则R检查失败并显示错误

> fatal error: vector: No such file or directory
> E>  #include <vector>
> E>           ^~~~~~~~
> E> compilation terminated.

我已尝试在DESCRIPTION文件中使用LinkingTo: vector，如另一个答案所述，但这不起作用。

解决方法

最近添加的标题为Thirteen Simple Steps for Creating an R Package with an External Library的小插图涵盖了您要的主题。

从广义上讲，可以使用三种类型的带有外部库的软件包：

• 仅标头，这很容易，因为您只需要注意-I...标志
• 嵌入式，这很容易，因为软件包中可以包含 small 库
• 可能是最大库的外部库，这是最难的变体

外部库最难，因为R的可移植性使您担心如何在Windows，macOS和不同的Linux版本上使用该库进行构建。

所有这些，这里，您的问题必须更根本。我们不能多说，因为您没有提供MCVE，但是很容易证明Rcpp当然知道 在哪里STL向量类在哪里（初始代码是一行，在这里为仅限博览会）

R> Rcpp::cppFunction("std::vector<int> doubleMe(std::vector<int> x) { \
      std::vector<int> y(x.size()); for (size_t i=0; i<x.size(); i++) \
           y[i] = x[i]+x[i]; return y; }")
R> doubleMe(1:3)
[1] 2 4 6
R> 

清楚地表明Rcpp知道在哪里可以找到该头文件-因此，要么以某种非常不寻常的方式在计算机上安装了编译器和库，要么安装了R，或者以错误的方式调用了R。有关Rcpp的更多详细信息，请参见A Brief Introduction to Rcpp。

使用Rcpp类型的PS只是

R> Rcpp::cppFunction("IntegerVector doubleMe(IntegerVector x) { return x+x; }")
R> doubleMe(2:4)
[1] 4 6 8
R> 

PPS当然，您也可以在没有Rcpp 的情况下完成所有这些操作，有关操作方法，请参见Writing R Extensions（在此情况下为必读）手册。在我的talks page上，我链接了十年以上的几个（较旧的）教程，这些教程都显示了示例。由于该实际上很麻烦，因此我建议使用Rcpp。

,

我想您正在使用Rcpp软件包。看看Rcpp vignette可能是个好主意。官方Writing R Extensions手册在这里也很有用。这些包含您需要的很多信息。

如果您只需要专门使用vector，或者只想包含任何非标准库，就会有所不同。

如果只需要使用向量，则可以在LinkingTo: Rcpp文件中包含DESCRIPTION，并在完成添加Rcpp的所有其他必需步骤之后，一个c ++文件看起来像下面的示例小插图：

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]
List rcpp_hello_world() {
  CharacterVector x = CharacterVector::create("foo","bar");
  NumericVector y = NumericVector::create( 0.0,1.0 ) ;
  List z = List::create( x,y ) ;

  return z ;
}

因此，您将使用Rcpp::NumericVector名称空间提供的Rcpp。

如果您需要其他库（例如，提升图书馆。有多种方法可以将其保存/存档，但也有很多信息，还有一些具有实用答案的问题，例如How to build a R package which use Rcpp with external c++ libraries?

您还可以查看使用Rcpp和其他c ++库（例如boost）的其他R包。 DescTools是一个很好的例子（Git DescTools）。

我建议您尝试按照Rcpp插图中的指南正确设置Rcpp，如果仍然无法通过Rcpp进行安装，请在此处提供更详细的信息，包括您要尝试添加的库以及失败的地方。