添加和Rcpp文件到现有的r包?

如何解决添加和Rcpp文件到现有的r包?

我已经制作了一个简单的R包(纯R)来解决蛮力问题,然后我尝试通过编写Rcpp脚本来加快代码速度。我编写了一个脚本,将运行时间与“ bench”库进行比较。现在,如何将该脚本添加到程序包中?我试图添加

#'@importFrom Rcpp cppFunction 
在我的R脚本顶部

并将Rcpp文件插入scr文件夹中,但是没有用。有没有一种方法可以将其添加到我的r包中,而无需从头开始创建包?很抱歉,是否已经有人问过我,但我是陌生的,完全迷路了。

解决方法

这种转换实际上(仍然)非常困难(就需要多个文件而言)。很容易忽略细节。让我向您介绍原因。

让我们假设您使用R软件包package.skeleton()启动了一个工作软件包。那是最简单,最普遍的情况。该程序包将起作用(但有警告,请参阅我的pkgKitten程序包以获取包装而不是清除信息,还有其他十个程序包有助于CRAN上的功能和程序包)。特别要注意的是,关于roxygen2我什么也没说,这只是增加了一点复杂性,因此让我们只关注.Rd文件。

您现在可以将最简单的软件包与Rcpp所构建的软件包进行对比,即使用Rcpp.package.skeleton()。您至少会看到 这些差异

  • DESCRIPTION代表LinkingTo:Imports
  • NAMESPACE代表importFrom以及useDynLib
  • 新的src目录以及可能需要的src/Makevars

所有这些使通过Rcpp.package.skeleton()(基本上)启动新程序包和将现有程序包代码复制到该程序包中变得更加容易。我们只是没有转换助手。我仍然会不时地进行您尝试的“手动转换”,甚至我需要尝试一两次,而且我已经多次看到所有错误消息...

因此,即使您不想“复制所有内容”,我认为最简单的方法是

  • 使用和不使用Rcpp
  • 创建两个软件包
  • 执行递归diff
  • 确保差异适用于您的原始包装。

PS请记住,当您使用roxygen2并在src/目录中拥有文档时,始终要先运行Rcpp::compileAttributes(),然后再运行roxygen2::roxygenize()。 RStudio和其他助手为您做到了,但是仍然很容易忘记...

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