xgboost.plot_tree显示-空字符/框/块作为标签

如何解决xgboost.plot_tree显示-空字符/框/块作为标签

情况

当我绘制xgboost.plot_tree时，仅在图形上得到了一堆空字符/框/块，而不是标题，标签和数字。我使用了400多个功能，因此可以成为其中的一个促成因素。

代码1

fig,ax = plt.subplots(figsize=(170,170))
plot_tree(xgbmodel,ax=ax)
plt.savefig("temp.pdf")
plt.show()

代码2

plot_tree(xgbmodel,num_trees=2)
fig = plt.gcf()
fig.set_size_inches(150,100)
fig.savefig('tree.png')

错误

• 代码1和代码2产生相同的图像
• 这只是整棵树的一部分，因为它更大，所以我不能在这里上传，但是树的形状看起来很完美。

我尝试过的解决方案

• 这存在绘图问题，我可以毫无问题地进行绘图-Plot a Single XGBoost Decision Tree
• 这还有其他问题-xgboost.plot_tree: binary feature interpretation
• 我已经绘制了@jared_mamrot给我的代码，它带来了相同的错误，我重新启动并清理了我的环境，并且只能在同一笔记本上运行此拳头。

  

• GitHub Recommendation的model.get_booster().get_dump(dump_format='text')打印出的字体略多于200'000个字符= 63张A4大小的11尺寸Calibri字体的页面，看起来很正确，例如：0.0268656723\n\t\t\t\t\t34:[f0<6.5] yes=53,no=54,missing=53\n\t\t\t\t\t\。我可能有这个问题，因为它不能在这么大的尺寸图中显示太多文本吗？

解决方法

我无法重现您的错误。您能否在问题中添加更多详细信息并确认此代码有效？ link to pima-indians-diabetes.csv

#!/usr/bin/env python3

# plot decision tree
from numpy import loadtxt
from xgboost import XGBClassifier
from xgboost import plot_tree
import matplotlib.pyplot as plt
import graphviz

# load data
dataset = loadtxt('pima-indians-diabetes.csv',delimiter=",")

# split data into X and y
X = dataset[:,0:8]
y = dataset[:,8]

# fit model no training data
model = XGBClassifier()
model.fit(X,y)

# plot/save fig
fig,ax = plt.subplots(figsize=(170,170))
plot_tree(model,ax=ax)
plt.savefig("test.pdf")

编辑每个评论：

我无法重现此问题/错误。无论哪个包版本/ char编码/行尾/等，我的笔记本始终可以正确显示文本。我唯一能建议的就是使用所需软件包的最新版本（conda安装笔记本numpy matplotlib xgboost graphviz python-graphviz）安装新的虚拟环境（例如miniconda）并再次进行测试。

此外，请确保您没有Windows行尾（请参阅：Matplotlib plotting some characters as blank square / https://github.com/jupyterlab/jupyterlab/issues/1104 / https://github.com/jupyterlab/jupyterlab/issues/3718 / https://github.com/jupyterlab/jupyterlab/pull/3882）并指定要使用的字体（例如How to change fonts in matplotlib (python)?）：

# plot decision tree
from numpy import loadtxt
from xgboost import XGBClassifier
from xgboost import plot_tree
from matplotlib.font_manager import FontProperties
import matplotlib.pyplot as plt
import graphviz

# load data
dataset = loadtxt('pima-indians-diabetes.csv',y)

# plot/save fig
prop = FontProperties()
prop.set_file('Arial.ttf')
fig,ax=ax,fontproperties=prop)
plt.savefig("test.png")
fig.show()

,

我已经将整个环境从AWS EC2移到了本地机器上，而不是运行得很好。 AWS EC2还有其他一些奇怪的事情，例如不允许在Jupyter Lab中使用Extension。它们都是Ubuntu 20.04 LTS。