在nlme包中使用nlme时的输入函数

如何解决在nlme包中使用nlme时的输入函数

我已经尝试过nlmer()函数,但是由于某种原因它无法收敛。现在我正在尝试在nlme包中使用nlme()函数,我的功能在下面

NLSite <- function(PSAr,Vs30,h800,b1,b2,b3,c){
 
  #Linear term
  .exprN1 <- ifelse(Vs30>1000,1000/760,Vs30/760)
  .exprN2 <- log(.exprN1)
  .valueN <- b1*.exprN2
 
  # Depth-to-rock term (in log)   #!!!!!!!!!!!!!!!!!! z<1 = 1 i deleted it dont forget to change!!!!!!!!!!!!!!
  # in SD18 they are estimated from CY08 equation for Z1
  h800[h800<1]<-1
  .exprZ1 <- ifelse(Vs30>=760,1,h800)
  .exprZ2 <- log(.exprZ1)
  .valueZ <- b2*.exprZ2
 
  #Nonlinear term
  .exprNL1 <- ifelse(Vs30>760,760-360,Vs30-360)
  .exprNL2 <- -0.00701*.exprNL1
  .exprNL3 <- exp(.exprNL2)
  .exprNL4 <- -0.00701*400
  .exprNL5 <- exp(.exprNL4)
  .exprNL6 <- .exprNL3 - .exprNL5
  .exprNL7 <- PSAr/c
  .exprNL8 <- 1+.exprNL7 #log(1+PSAr/c)
  .exprNL9 <- log(.exprNL8)
  .valueNL <- b3*.exprNL9*.exprNL6
 
 
  .value <- 0 + .valueN + .valueZ + .valueNL
 
  .grad <- array(0,c(length(.value),4L),list(NULL,c("b1","b2","b3","c")))  
 
  ## e1 ##
 
  ## b1,b3 ##
  .grad[,"b1"] <- .exprN2
  .grad[,"b2"] <- .exprZ2
  .grad[,"b3"] <- .exprNL9*.exprNL6
  .grad[,"c"] <- b3*.exprNL6*((1/(.exprNL8))*(-.exprNL7/c))
 
 
  attr(.value,"gradient") <- .grad
  .value
}

我试图像这样运行nlme()

fm1 <- nlme(log(PSAm) ~ NLSite(PSAr,c),data = data,fixed = b1+ b2+ b3~1,random = EQID~1,start = c(b1 = 1,b2 = 1,b3 = 1,c=0.1))

b1,b2,b3和c是我的固定效应,我在lmer中的随机效应是(1 | EQID),EQID是我的数据框(数据)中的地震ID,我在lmer中的结构在下面

fm <-lmer(log(data$PSAm)~ 0  + data$VN + data$Z1 + data$VN03 + data$VN19 + data$VN21 + data$VN28 + (1|data$EQID),data,REML=FALSE)

感谢您的关注。

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