如何解决使用 MPI_Scatter 向所有其他进程发送一个数组索引的进程的错误输出
我只是想了解 MPI,但似乎无法理解为什么以下程序的输出与我预期的不同。
int rank,size;
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&size);
int *sendbuf,*recvbuf;
sendbuf = (int *) malloc(sizeof(int) * size);
recvbuf = (int *) malloc(sizeof(int) * size);
for(int i = 0; i < size; i++) {
sendbuf[i] = rank;
}
for(int i = 0; i < size; i++) {
printf("sendbuf[%d] = %d,rank: %d\n",i,sendbuf[i],rank);
}
MPI_Scatter(sendbuf,1,MPI_INT,recvbuf,rank,MPI_COMM_WORLD);
for(int i = 0; i < size; i++) {
printf("recvbuf[%d] = %d,recvbuf[i],rank);
}
据我所知,MPI_Scatter 将 sendcount
值从数组发送到所有进程。
在我的示例中,我为每个进程提供了一个填充了自己的等级编号的数组。
然后每个进程将其数组中的一个索引发送给所有其他进程。有两个进程,第一个进程有一个 sendbuf 数组:
sendbuf[0] = 0
sendbuf[1] = 0
第二个进程(等级 1)有一个大小为 MPI_Comm_size
的数组,其中填充了 1。
预期的输出应该是:
recvbuf[0] = 0,rank: 0
recvbuf[1] = 1,rank: 0
recvbuf[0] = 0,rank: 1
revcbuf[1] = 1,rank: 1
但我得到以下输出(对于两个进程):
sendbuf[0] = 0,rank: 0
sendbuf[1] = 0,rank: 0
sendbuf[0] = 1,rank: 1
sendbuf[1] = 1,rank: 1
recvbuf[0] = 0,rank: 0
recvbuf[1] = 32690,rank: 0
recvbuf[0] = 1,rank: 1
recvbuf[1] = 32530,rank: 1
非常感谢任何指出我错误的帮助。
解决方法
我只是想了解 MPI,但似乎无法理解 明白了,为什么下面的程序输出和我的不一样 期待。
问题在于使用 MPI_Scatter 来实现您的目标:
将数据从一个进程发送到通信器中的所有其他进程 概要
int MPI_Scatter(const void *sendbuf,int sendcount,MPI_Datatype sendtype,void *recvbuf,int recvcount,MPI_Datatype recvtype,int root,MPI_Comm comm) 输入参数
sendbuf 发送缓冲区地址(选择,仅在 root 处有效)
sendcount 发送到每个进程的元素数(整数,仅在 root 处有效)
sendtype 发送缓冲区元素的数据类型(仅在 root 处有效)(句柄)
recvcount 接收缓冲区中的元素数(整数)
recvtype 接收缓冲区元素的数据类型(句柄)
root 发送进程的等级(整数)
comm 通讯器(手柄)
每个进程都应该调用 MPI_Scatter
具有相同的根,而不是像您所做的那样使用不同的根(即进程的等级):
MPI_Scatter(sendbuf,1,MPI_INT,recvbuf,rank,MPI_COMM_WORLD);
^^^^
因此,您误用了 MPI_Scatter
,该例程的目的是“将数据从一个进程发送到通信器中的所有其他进程”。 下图(取自source) 最好地说明了这一点:
只有一个根进程,它将数据分散到不同的进程中。例如,当一个进程有一个数据块(例如,一个数组)并且代码对这些数据执行一些操作时,就会使用这个例程。您可以通过在进程之间拆分数据来并行化代码,其中每个进程对其分配的数据块并行执行上述操作。之后,您可以调用 MPI_Gather 将所有进程的数据收集回原始数据来自的进程。
然后每个进程将其数组中的一个索引发送给所有其他进程 过程。
为此,您可以改用 MPI_Allgather,它“从所有任务收集数据并将组合数据分发给所有任务”。下图(取自 source)最能说明这一点:
如您所见,每个进程都会收集所有进程(包括其自身)发送的数据。
运行示例:
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <mpi.h>
int main(int argc,char **argv){
int rank,size;
MPI_Init(&argc,&argv);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD,&size);
int *sendbuf = malloc(sizeof(int) * size);
int *recvbuf = malloc(sizeof(int) * size);
for(int i = 0; i < size; i++)
sendbuf[i] = rank;
MPI_Allgather(sendbuf,MPI_COMM_WORLD);
for(int i = 0; i < size; i++)
printf("recvbuf[%d] = %d,rank: %d\n",i,recvbuf[i],rank);
MPI_Finalize();
return 0;
}
OUTPUT 用于两个进程:
recvbuf[0] = 0,rank: 0
recvbuf[1] = 1,rank: 0
recvbuf[0] = 0,rank: 1
recvbuf[1] = 1,rank: 1
对于您的特定情况(具有相同的输入大小),MPI_Alltoall 也可以使用,以了解 MPI_Allgather
与 MPI_Alltoall
之间的差异,我建议你检查这个SO thread。
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