使用 tifffile 拆分 BigTiff

如何解决使用 tifffile 拆分 BigTiff

我在拆分 BigTiff 时遇到问题。我最初使用此 question 中的 @Ivan 代码。由于我使用的是大于 4GB 的 .tif，因此我不得不对其进行一些修改。枕头 does not support BigTiffs。所以我最终使用了 tifffile。代码正在运行，但图像没有被裁剪到 box 参数。我认为它必须这样做 tifffile 将图像读取为 numpy array 并且实际上没有被任何东西剪掉？？？

我还注意到，当这段代码运行时，我的内存即将耗尽。我尝试将数据类型分配给未分配的 8 位，这非常有帮助。我也应该压缩它吗？我不想对数据进行太多更改，因为我会对它们进行分类并且不想丢失/更改数据。

import os
from itertools import product
import tifffile

def tile(filename,dir_in,dir_out,d):
    name,ext = os.path.splitext(filename)
    img = tifffile.imread(os.path.join(dir_in,filename))
    print(type(img))
    w = img.shape[0]
    h = img.shape[1]


    grid = list(product(range(0,h - h % d,d),range(0,w - w % d,d)))
    for i,j in grid:
        box = (j,i,j + d,i + d)
        out = os.path.join(dir_out,f'{name}_{i}_{j}{ext}')
        img = img.clip(box)
        img = img.astype('uint8')
        tifffile.imsave(out,img)


tile('Orthomosaic_export_MonFeb01193821460106.tif',r'D:\ortho',r'D:\model_images',1000)

解决方法

最终将这个 answer 合并到我的代码中并最终让它运行。

import os
import tifffile

def tile(filename,dir_in,dir_out):
    name,ext = os.path.splitext(filename)
    img = tifffile.imread(os.path.join(dir_in,filename))

    windowsize_r = 10000
    windowsize_c = 10000

    i = 0
    for r in range(0,img.shape[0] - windowsize_r,windowsize_r):
        for c in range(0,img.shape[1] - windowsize_c,windowsize_c):
            window = img[r:r + windowsize_r,c:c + windowsize_c]
            out = os.path.join(dir_out,f'{name}_{i}_{ext}')
            tifffile.imsave(out,window)
            i = i + 1

tile('Shopfield_Orthomosaic_export_MonFeb01193821460106.tif',r'D:\ortho',r'D:\model_images')