如何解决R [DescTools?] 中两个范围的重叠量
我需要知道两个数字范围重叠的整数数量。我尝试使用 DescTools::Overlap，但输出不是我所期望的。
library(DescTools)
library(tidyr)
df1 <- data.frame(ID = c('a','b','c','d','e'),var1 = c(1,2,3,4,5),var2 = c(9,5,7,11))
df1 %>% setNames(paste0(names(.),'_2')) %>% tidyr::crossing(df1) %>% filter(ID != ID_2) -> pairwise
pairwise$overlap <- DescTools::Overlap(c(pairwise$var1,pairwise$var2),c(pairwise$var1_2,pairwise$var2_2))
对于上面创建的测试数据集中的每一行，输出（整列）为“10”。我想要每个行特定的重叠，所以前 3 列分别是 2,4。
解决方法
我发现最简单的方法是使用 rowwise。以前不建议使用此操作，但自 dplyr 1.0.0 发布以来，它在性能方面得到了改进。
pairwise %>%
rowwise() %>%
mutate(overlap = Overlap(c(var1,var2),c(var1_2,var2_2))) %>%
ungroup()
#> # A tibble: 20 x 7
#> ID_2 var1_2 var2_2 ID var1 var2 overlap
#> <chr> <dbl> <dbl> <chr> <dbl> <dbl> <dbl>
#> 1 a 1 9 b 2 3 1
#> 2 a 1 9 c 3 5 2
#> 3 a 1 9 d 4 7 3
#> 4 a 1 9 e 5 11 4
#> 5 b 2 3 a 1 9 1
#> 6 b 2 3 c 3 5 0
#> 7 b 2 3 d 4 7 0
#> 8 b 2 3 e 5 11 0
#> 9 c 3 5 a 1 9 2
#> 10 c 3 5 b 2 3 0
#> 11 c 3 5 d 4 7 1
#> 12 c 3 5 e 5 11 0
#> 13 d 4 7 a 1 9 3
#> 14 d 4 7 b 2 3 0
#> 15 d 4 7 c 3 5 1
#> 16 d 4 7 e 5 11 2
#> 17 e 5 11 a 1 9 4
#> 18 e 5 11 b 2 3 0
#> 19 e 5 11 c 3 5 0
#> 20 e 5 11 d 4 7 2
我的带有 apply 函数的版本
pairwise$overlap <- apply(pairwise,1,function(x) DescTools::Overlap(as.numeric(c(x[5],x[6])),as.numeric(c(x[2],x[3]))))
pairwise
# A tibble: 20 x 7
ID_2 var1_2 var2_2 ID var1 var2 overlap
<chr> <dbl> <dbl> <chr> <dbl> <dbl> <dbl>
1 a 1 9 b 2 3 1
2 a 1 9 c 3 5 2
3 a 1 9 d 4 7 3
4 a 1 9 e 5 11 4
5 b 2 3 a 1 9 1
6 b 2 3 c 3 5 0
7 b 2 3 d 4 7 0
8 b 2 3 e 5 11 0
9 c 3 5 a 1 9 2
10 c 3 5 b 2 3 0
11 c 3 5 d 4 7 1
12 c 3 5 e 5 11 0
13 d 4 7 a 1 9 3
14 d 4 7 b 2 3 0
15 d 4 7 c 3 5 1
16 d 4 7 e 5 11 2
17 e 5 11 a 1 9 4
18 e 5 11 b 2 3 0
19 e 5 11 c 3 5 0
20 e 5 11 d 4 7 2
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