如何解决使用 url 作为文件名输入的循环函数
我在另一台服务器上有多个 files
,需要在 script
之后下载、处理和删除。下载 url 在脚本中定义为 $FILE
。但是,我不确定如何在第二个命令 $FILE
中使用 samtools
调用实际文件名,因为文件名是 url 的最后一部分,因此与“$FILE”不同。任何建议如何定义文件名(即 url 中最后一个 / 之后的部分,如下 * 所示),以便我可以在 samtools 函数中输入和输出唯一的文件,并在使用 { 处理后删除相同的文件{1}}。
测试.txt
rm
脚本
gs://hmf-cram-xfdrvdrv/file123535_dedup.realigned.cram.crai
gs://hmf-cram-dvdvdv/file12353535_dedup.realigned.cram.crai
gs://hmf-cram-evd/file46475754_dedup.realigned.cram.crai
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