使用 Pybind11 在 Python 中调用并行 C++ 代码

如何解决使用 Pybind11 在 Python 中调用并行 C++ 代码

我有一个与 OpenMP 并行运行的 C++ 代码,执行一些长计算。这部分效果很好。

现在,我正在使用 Python 围绕此代码制作 GUI。所以,我想在我的 python 程序中调用我的 C++ 代码。为此,我使用 Pybind11(但我想如果需要我可以使用其他东西)。

问题是当从 Python 调用时,我的 C++ 代码串行运行,只有一个线程/CPU。

我尝试(以两种方式)了解 pybind11 here 的文档中做了什么,但它似乎根本不起作用。

我的绑定看起来像这样:

#include <pybind11/pybind11.h>
#include <pybind11/stl.h>
#include "../cpp/include/myHeader.hpp"
namespace py = pybind11;

PYBIND11_MODULE(my_module,m) {
    m.def("testFunction",&testFunction,py::call_guard<py::gil_scoped_release>());

    m.def("testFunction2",[](inputType input) -> outputType {
        /* Release GIL before calling into (potentially long-running) C++ code */
        py::gil_scoped_release release;
        outputType output =  testFunction(input);
        py::gil_scoped_acquire acquire;

        return output;
    });
}

问题:这仍然不起作用并且只使用了一个线程(我通过在 omp 并行区域中打印 omp_get_num_threads() 来验证这一点)。

问题:我做错了什么?我需要做什么才能在 Python 中使用并行 C++ 代码?

免责声明:我必须承认我并不真正了解 GIL,特别是在我的 C++ 代码中没有使用 Python 的情况下,这在理论上确实是“独立的”。我只是希望能够在另一个(Python)代码中使用它。

祝您有美好的一天。

编辑: 由于 pptaszni 的回答,我已经解决了我的问题。事实上,根本不需要 GIL 的东西,我误解了文档。 pptaszni 的代码有效,实际上这是我的 CMake 文件的问题。 谢谢。

解决方法

这不是一个很好的答案(评论时间太长),因为我没有重现您的问题,但也许您可以通过尝试这个对我有用的示例来隔离代码中的问题:

C++ 代码:

#include "OpenMpExample.hpp"

#include <algorithm>
#include <iostream>
#include <random>
#include <vector>

#include <omp.h>

constexpr int DATA_SIZE = 10000000;

std::vector<int> testFunction()
{
  int nthreads = 0,tid = 0;
  std::vector<std::vector<int> > data;
  std::vector<int> results;
  std::random_device rnd_device;
  std::mt19937 mersenne_engine {rnd_device()};
  std::uniform_int_distribution<int> dist {-10,10};
  auto gen = [&dist,&mersenne_engine](){ return dist(mersenne_engine); };

  #pragma omp parallel private(tid)
  {
    tid = omp_get_thread_num();
    if (tid == 0)
    {
      nthreads = omp_get_num_threads();
      std::cout << "Num threads: " << nthreads << std::endl;
      data.resize(nthreads);
      results.resize(nthreads);
    }
  }
  
  #pragma omp parallel private(tid) shared(data,gen)
  {
    tid = omp_get_thread_num();
    data[tid].resize(DATA_SIZE);
    std::generate(data[tid].begin(),data[tid].end(),gen);
  }
  #pragma omp parallel private(tid) shared(data,results)
  {
    tid = omp_get_thread_num();
    results[tid] = std::accumulate(data[tid].begin(),0);
  }
  for (auto r : results)
  {
    std::cout << r << ",";
  }
  std::cout << std::endl;
  return results;
}

我试图保持代码简短,但强制机器同时实际进行一些计算。每个线程生成 10^7 个随机整数,然后将它们相加。那么python绑定甚至不需要gil_scoped_release

#include <pybind11/pybind11.h>
#include <pybind11/stl.h>
#include "OpenMpExample.hpp"
namespace py = pybind11;

// both versions work for me
// PYBIND11_MODULE(mylib,m) {
//     m.def("testFunction",&testFunction,py::call_guard<py::gil_scoped_release>());
// }

PYBIND11_MODULE(mylib,m) {
    m.def("testFunction",&testFunction);
}

python 输出示例:

Python 3.6.8 (default,Jun 29 2020,16:38:14) 
[GCC 7.5.0] on linux
Type "help","copyright","credits" or "license" for more information.
>>> import mylib
>>> x = mylib.testFunction()
Num threads: 12
-10975,-22101,-11333,-28603,-471,-15505,-18141,2887,-6813,-5328,-13975,-4321,

我的环境:Ubuntu 18.04.3 LTS、gcc 8.4.0、openMP 201511、python 3.6.8;

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。

相关推荐


依赖报错 idea导入项目后依赖报错,解决方案:https://blog.csdn.net/weixin_42420249/article/details/81191861 依赖版本报错:更换其他版本 无法下载依赖可参考:https://blog.csdn.net/weixin_42628809/a
错误1:代码生成器依赖和mybatis依赖冲突 启动项目时报错如下 2021-12-03 13:33:33.927 ERROR 7228 [ main] o.s.b.d.LoggingFailureAnalysisReporter : *************************** APPL
错误1:gradle项目控制台输出为乱码 # 解决方案:https://blog.csdn.net/weixin_43501566/article/details/112482302 # 在gradle-wrapper.properties 添加以下内容 org.gradle.jvmargs=-Df
错误还原:在查询的过程中,传入的workType为0时,该条件不起作用 &lt;select id=&quot;xxx&quot;&gt; SELECT di.id, di.name, di.work_type, di.updated... &lt;where&gt; &lt;if test=&qu
报错如下,gcc版本太低 ^ server.c:5346:31: 错误:‘struct redisServer’没有名为‘server_cpulist’的成员 redisSetCpuAffinity(server.server_cpulist); ^ server.c: 在函数‘hasActiveC
解决方案1 1、改项目中.idea/workspace.xml配置文件,增加dynamic.classpath参数 2、搜索PropertiesComponent,添加如下 &lt;property name=&quot;dynamic.classpath&quot; value=&quot;tru
删除根组件app.vue中的默认代码后报错:Module Error (from ./node_modules/eslint-loader/index.js): 解决方案:关闭ESlint代码检测,在项目根目录创建vue.config.js,在文件中添加 module.exports = { lin
查看spark默认的python版本 [root@master day27]# pyspark /home/software/spark-2.3.4-bin-hadoop2.7/conf/spark-env.sh: line 2: /usr/local/hadoop/bin/hadoop: No s
使用本地python环境可以成功执行 import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt # 设置字体 plt.rcParams[&#39;font.sans-serif&#39;] = [&#39;SimHei&#39;] # 能正确显示负号 p
错误1:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误还原:controller层有一个接口,访问该接口时报错:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误原因:没有接收到前端传入的参数,修改为如下 参考 错误2:cannot r
错误1:启动docker镜像时报错:Error response from daemon: driver failed programming external connectivity on endpoint quirky_allen 解决方法:重启docker -&gt; systemctl r
错误1:private field ‘xxx‘ is never assigned 按Altʾnter快捷键,选择第2项 参考:https://blog.csdn.net/shi_hong_fei_hei/article/details/88814070 错误2:启动时报错,不能找到主启动类 #
报错如下,通过源不能下载,最后警告pip需升级版本 Requirement already satisfied: pip in c:\users\ychen\appdata\local\programs\python\python310\lib\site-packages (22.0.4) Coll
错误1:maven打包报错 错误还原:使用maven打包项目时报错如下 [ERROR] Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-resources-plugin:3.2.0:resources (default-resources)
错误1:服务调用时报错 服务消费者模块assess通过openFeign调用服务提供者模块hires 如下为服务提供者模块hires的控制层接口 @RestController @RequestMapping(&quot;/hires&quot;) public class FeignControl
错误1:运行项目后报如下错误 解决方案 报错2:Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-compiler-plugin:3.8.1:compile (default-compile) on project sb 解决方案:在pom.
参考 错误原因 过滤器或拦截器在生效时,redisTemplate还没有注入 解决方案:在注入容器时就生效 @Component //项目运行时就注入Spring容器 public class RedisBean { @Resource private RedisTemplate&lt;String
使用vite构建项目报错 C:\Users\ychen\work&gt;npm init @vitejs/app @vitejs/create-app is deprecated, use npm init vite instead C:\Users\ychen\AppData\Local\npm-