如何使用 Perl 中的循环计算文本文件部分中的元素数量?

如何解决如何使用 Perl 中的循环计算文本文件部分中的元素数量?

我正在寻找一种在 Perl 中创建脚本的方法,以计算文本文件中的元素并分部分进行。例如,我的文本文件具有以下形式:

ID                       Position   Potential  Jury agreement NGlyc result
(PART 1)
NP_073551.1_HCoV229Egp2   23 NTSY   0.5990     (8/9)           +     
NP_073551.1_HCoV229Egp2   62 NTSS   0.7076     (9/9)           ++        
NP_073551.1_HCoV229Egp2  171 NTTI   0.5743     (5/9)           +     
...
(PART 2)
QJY77946.1_NA             20 NGTN   0.7514     (9/9)           +++   
QJY77946.1_NA             23 NTSH   0.5368     (5/9)           +     
QJY77946.1_NA             51 NFSF   0.7120     (9/9)           ++    
QJY77946.1_NA             62 NTSS   0.6947     (9/9)           ++  
...
(PART 3)
QJY77954.1_NA             20 NGTN   0.7694     (9/9)           +++   
QJY77954.1_NA             23 NTSH   0.5398     (5/9)           +     
QJY77954.1_NA             51 NFSF   0.7121     (9/9)           ++      
...
(PART N°...)

就像您看到的一样,每个部分的 ID 都是相同的(一个用于第 1 部分,另一个用于第 2 部分,然后……)。变化只能在 Position//Potential//陪审团协议//NGlyc结果列中看到 然后,我的主要目标是计算 Potential 0,7 >= 的行。

考虑到这一点,我正在寻找这样的输出:

Part 1: 
1 (one value 0.7 >=)
Part 2: 
2 (two values 0.7 >=)
Part 3: 
2 (two values 0.7 >=)
Part N°:
X numbers of values 0.7 >= 

此输出告诉我每个 ID 的正值数量(0.7 >=)。

我认为伪代码应该是这样的:

foreach ID in LIST
    foreach LINE in FILE
        if (ID is in LINE)
           ... count the line ...
    end foreach LINE
end foreach ID

我正在寻找任何建议(对于包或脚本想法)或评论以创建更好的脚本。

谢谢!最好!

解决方法

要计算与特定列上的某些条件匹配的每个部分的行数,您只需遍历行,跳过标题,解析部分编号,并使用数组来计算行数匹配每个部分。

在此之后,您可以循环遍历数组中记录的计数并以您的特定格式将它们打印出来。

#!/usr/bin/perl
use strict;
use warnings;

my $part = 0;
my @cnt_part;
while(my $line = <STDIN>) {
    if($. == 1) {
        next;
    }elsif($line =~ m{^\(PART (\d+)\)}) {
        $part = $1;
    }else {
        my @cols = split(m{\s+},$line);
        if(@cols == 6) {
            my $potential = $cols[3];
            if(0.7 <= $potential) {
                $cnt_part[$part]++;
            };
        };
    };
};

for(my $i=1;$i<=$#cnt_part;$i++){
    print "Part $i:\n";
    print "$cnt_part[$i] (values 0.7 <=)\n";
};

要运行它,只需通过 Perl 脚本管道传输整个文件:

cat in.txt | perl count.pl

你会得到这样的输出:

Part 1:
1 (values 0.7 <=)
Part 2:
2 (values 0.7 <=)
Part 3:
2 (values 0.7 <=)

如果您还想将计数显示为单词,您可以使用 Lingua::EN::Numbers(请参阅 this program )并且您会得到与您帖子中的输出非常相似的输出:

Part 1:
1 (one values 0.7 <=)
Part 2:
2 (two values 0.7 <=)
Part 3:
2 (two values 0.7 <=)

这篇文章中的所有代码也是available here

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