AttributeError: 'Dataset' 对象没有属性 'value'

如何解决AttributeError: 'Dataset' 对象没有属性 'value'

我在使用包读取 hdf5 文件时遇到此错误：

dataset.value

错误：

Traceback (most recent call last):
  File "train.py",line 163,in <module>
    train(0,False,args.gpu_list,args.model_path)
  File "train.py",line 76,in train
    dataset = Ani1Dataset(dir_path='/data/ANI-1_release')
  File "/code/ani1dataset.py",line 16,in __init__
    self.parse(dir_path)
  File "/code/ani1dataset.py",line 32,in parse
    for molecule in adl:
  File "/code/pyanitools.py",line 75,in __iter__
    for data in self.h5py_dataset_iterator(self.store):
  File "/code/pyanitools.py",line 71,in h5py_dataset_iterator
    yield from self.h5py_dataset_iterator(item,path)
  File "/code/pyanitools.py",line 60,in h5py_dataset_iterator
    dataset = np.array(item[k].value)
AttributeError: 'Dataset' object has no attribute 'value'

解决方法

是的，.value 已被弃用一段时间。正如我在上面的评论中提到的，如果没有令人信服的理由，我不会降级到 h5py 2.9.0。它于 2014 年发布。当前的 h5py 版本是 3.2，支持最新的 HDF5 格式，并有许多增强和错误更正。

使用 h5py 访问 HDF5 数据有两种主要方式。简而言之，您可以：

1. 返回一个 h5py 数据集对象。数据集对象的行为“如同”它是一个数组，但在需要之前不会将数据加载到内存中。
2. 返回一个 NumPy 数组。这会立即将数据加载到内存中。

Complete h5py dataset documentation here:
以下每个示例：

with h5py.File('filename.h5','r') as h5f:
    # return a h5py dataset object:
    my_ds_obj = h5f[ds_name]
    # return a h5py dataset object:
    my_ds_arr = h5f[ds_name][:]

此外，如果您只想读取部分数据，h5py 支持大多数 NumPy 切片语法，包括花式索引的子集。 h5py fancy indexing doc

,

dataset.value 属性已弃用。要么使用：

dataset[()]

或降级 h5py 以使用旧语法：

pip3 install --upgrade pip && pip3 install h5py=='2.9.0'