R语言:沿时间轴计算单元格中的偏相关因子

如何解决R语言:沿时间轴计算单元格中的偏相关因子

##希望用R语言做偏相关分析 图片。例如,当我有降水(2000-2017)和温度数据(2000-2017)和植被净初级生产力(2000-2017)的栅格数据时,我想在降水为持续的。我将npp栅格数据(2000-2017)、降水栅格数据(2000-2017)、温度栅格数据(2000-2017)组合成一个栅格堆栈,共54个波段,1-18个波段代表时间序列NPP,19-36 波段代表温度时间序列,37-54 代表降水时间序列。进行偏相关分析,降水一定时,NPP与温度的偏相关。

 ##combined raster bb :NPP(2000-2017);Precipitation(2000- 
      2017);temperature2000-2017
  bb<-stack("G:\\NPP_Partial_relation\\npp_tem_pre")
  plot(bb)
  #partial correlation function
  stack.correlation <- function(stack1){
  ##output template
  cor.map <- raster(stack1)
  # the number of bands
  rnlayers=nlayers(stack1)
  # the function takes a vector,partitions it in one third,then partial correlates
  # returning the partial correlation coefficient. 
  stack.sequence.cor <- function(myvec,na.rm=T){
    #print(myvec)
    ##delete infinite value
    if (all(is.infinite(myvec))) {
      NA_real_
    } else {

     ####extract the time series of NPP  data (1-18 layer means 2000-2017)
    myvecT1<-myvec[1:(length(myvec)/3)]
    ####extract the time series of temperature  data (19-36 layer means 2000-2017)
    myvecT2<-myvec[((length(myvec)/3)+1):((length(myvec)/3)*2)]
    ##extract the time series of precipitation  data (37-54 layer means 2000-2017)
    myvecT3<-myvec[(((length(myvec)/3)*2)+1):length(myvec)]
    ###dataframe
    tt<-data.frame(myvecT1,myvecT2,myvecT3)
    #print(tt)
    ##Partial correlation function:pcor.test()
    ttt<-pcor.test(tt[,1],tt[,2],3])
    tttt<-ttt$estimate
    return(tttt)

    }
  }
  # apply the function above to each cell and write the partial correlation
  # partial coefficient to the output template. 
  cor.map <- stackApply(stack1,indices = rep(1,rnlayers),fun = stack.sequence.cor)
  #print(cor.map)
  return(cor.map)
}
cor_r=stack.correlation(bb)

错误:运行代码后出现以下错误

#Error in (function (classes,fdef,mtable) : unable to find an inherited method for function ‘writeValues’ for signature ‘"RasterLayer","NULL"’

版权声明:本文内容由互联网用户自发贡献,该文观点与技术仅代表作者本人。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌侵权/违法违规的内容, 请发送邮件至 dio@foxmail.com 举报,一经查实,本站将立刻删除。

相关推荐


依赖报错 idea导入项目后依赖报错,解决方案:https://blog.csdn.net/weixin_42420249/article/details/81191861 依赖版本报错:更换其他版本 无法下载依赖可参考:https://blog.csdn.net/weixin_42628809/a
错误1:代码生成器依赖和mybatis依赖冲突 启动项目时报错如下 2021-12-03 13:33:33.927 ERROR 7228 [ main] o.s.b.d.LoggingFailureAnalysisReporter : *************************** APPL
错误1:gradle项目控制台输出为乱码 # 解决方案:https://blog.csdn.net/weixin_43501566/article/details/112482302 # 在gradle-wrapper.properties 添加以下内容 org.gradle.jvmargs=-Df
错误还原:在查询的过程中,传入的workType为0时,该条件不起作用 &lt;select id=&quot;xxx&quot;&gt; SELECT di.id, di.name, di.work_type, di.updated... &lt;where&gt; &lt;if test=&qu
报错如下,gcc版本太低 ^ server.c:5346:31: 错误:‘struct redisServer’没有名为‘server_cpulist’的成员 redisSetCpuAffinity(server.server_cpulist); ^ server.c: 在函数‘hasActiveC
解决方案1 1、改项目中.idea/workspace.xml配置文件,增加dynamic.classpath参数 2、搜索PropertiesComponent,添加如下 &lt;property name=&quot;dynamic.classpath&quot; value=&quot;tru
删除根组件app.vue中的默认代码后报错:Module Error (from ./node_modules/eslint-loader/index.js): 解决方案:关闭ESlint代码检测,在项目根目录创建vue.config.js,在文件中添加 module.exports = { lin
查看spark默认的python版本 [root@master day27]# pyspark /home/software/spark-2.3.4-bin-hadoop2.7/conf/spark-env.sh: line 2: /usr/local/hadoop/bin/hadoop: No s
使用本地python环境可以成功执行 import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt # 设置字体 plt.rcParams[&#39;font.sans-serif&#39;] = [&#39;SimHei&#39;] # 能正确显示负号 p
错误1:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误还原:controller层有一个接口,访问该接口时报错:Request method ‘DELETE‘ not supported 错误原因:没有接收到前端传入的参数,修改为如下 参考 错误2:cannot r
错误1:启动docker镜像时报错:Error response from daemon: driver failed programming external connectivity on endpoint quirky_allen 解决方法:重启docker -&gt; systemctl r
错误1:private field ‘xxx‘ is never assigned 按Altʾnter快捷键,选择第2项 参考:https://blog.csdn.net/shi_hong_fei_hei/article/details/88814070 错误2:启动时报错,不能找到主启动类 #
报错如下,通过源不能下载,最后警告pip需升级版本 Requirement already satisfied: pip in c:\users\ychen\appdata\local\programs\python\python310\lib\site-packages (22.0.4) Coll
错误1:maven打包报错 错误还原:使用maven打包项目时报错如下 [ERROR] Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-resources-plugin:3.2.0:resources (default-resources)
错误1:服务调用时报错 服务消费者模块assess通过openFeign调用服务提供者模块hires 如下为服务提供者模块hires的控制层接口 @RestController @RequestMapping(&quot;/hires&quot;) public class FeignControl
错误1:运行项目后报如下错误 解决方案 报错2:Failed to execute goal org.apache.maven.plugins:maven-compiler-plugin:3.8.1:compile (default-compile) on project sb 解决方案:在pom.
参考 错误原因 过滤器或拦截器在生效时,redisTemplate还没有注入 解决方案:在注入容器时就生效 @Component //项目运行时就注入Spring容器 public class RedisBean { @Resource private RedisTemplate&lt;String
使用vite构建项目报错 C:\Users\ychen\work&gt;npm init @vitejs/app @vitejs/create-app is deprecated, use npm init vite instead C:\Users\ychen\AppData\Local\npm-