Python / Numpy-快速找到最接近某个值的数组中的索引

如何解决Python / Numpy-快速找到最接近某个值的数组中的索引

|| 我有一个值数组t,该值始终按升序排列(但不总是等距排列)。我还有另一个单一值x。我需要在t中找到索引,以使t [index]最接近x。对于x t.max(),该函数必须返回最大索引(或-1)。 我已经写了两个函数来做到这一点。在这个简单的时序测试中,第一个f1更快。但是我喜欢第二个只是一行。该计算将在大型阵列上进行,每秒可能多次。 任何人都可以提出其他一些功能,使其时序与第一个功能相似,但代码看起来更简洁吗?比第一个更快(速度是最重要的)怎么样? 谢谢! 码:
import numpy as np
import timeit

t = np.arange(10,100000)         # Not always uniform,but in increasing order
x = np.random.uniform(10,100000) # Some value to find within t

def f1(t,x):
   ind = np.searchsorted(t,x)   # Get index to preserve order
   ind = min(len(t)-1,ind)      # In case x > max(t)
   ind = max(1,ind)             # In case x < min(t)
   if x < (t[ind-1] + t[ind]) / 2.0:   # Closer to the smaller number
      ind = ind-1
   return ind

def f2(t,x):
   return np.abs(t-x).argmin()

print t,\'\\n\',x,\'\\n\'
print f1(t,x),f2(t,\'\\n\'
print t[f1(t,x)],t[f2(t,\'\\n\'

runs = 1000
time = timeit.Timer(\'f1(t,x)\',\'from __main__ import f1,t,x\')
print round(time.timeit(runs),6)

time = timeit.Timer(\'f2(t,\'from __main__ import f2,6)
    

解决方法

这似乎要快得多(对我来说,Python 3.2-win32,numpy 1.6.0):
from bisect import bisect_left
def f3(t,x):
    i = bisect_left(t,x)
    if t[i] - x > 0.5:
        i-=1
    return i
输出:
[   10    11    12 ...,99997 99998 99999]
37854.22200356027
37844
37844
37844
37854
37854
37854
f1 0.332725
f2 1.387974
f3 0.085864
    ,“ 3”是二进制搜索(每次将数组分成两半)。因此,您必须以返回小于x的最后一个值而不是返回零的方式来实现它。 查看此算法(从此处开始):
def binary_search(a,x):
    lo=0
    hi = len(a)
    while lo < hi:
        mid = (lo+hi)//2
        midval = a[mid]
        if midval < x:
            lo = mid+1
        elif midval > x: 
            hi = mid
        else:
            return mid
    return lo-1 if lo > 0 else 0
只是替换了最后一行(是
return -1
)。还更改了参数。 由于循环是用Python编写的,因此它可能比第一个慢...(未进行基准测试)     ,使用搜索排序:
t = np.arange(10,100000)         # Not always uniform,but in increasing order
x = np.random.uniform(10,100000)

print t.searchsorted(x)
编辑: 嗯,是的,我知道这就是您在f1中所做的。也许下面的f3比f1更容易阅读。
def f3(t,x):
    ind = t.searchsorted(x)
    if ind == len(t):
        return ind - 1 # x > max(t)
    elif ind == 0:
        return 0
    before = ind-1
    if x-t[before] < t[ind]-x:
        ind -= 1
    return ind
    

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