Linux上的“快速选择”(或类似)实现? (而不是排序| uniq -c | sort -rn | head – $N)

问题:我经常需要查看特定日志最后一天内最常重复的“模式”.就像这里的一小部分tomcat日志一样:

GET /app1/public/pkg_e/v3/555413242345562/account/stats 401 954 5
GET /app1/public/pkg_e/v3/555412562561928/account/stats 200 954 97
GET /app1/secure/pkg_e/v3/555416251626403/ex/items/ 200 517 18
GET /app1/secure/pkg_e/v3/555412564516032/ex/cycle/items 200 32839 50
DELETE /app1/internal/pkg_e/v3/accounts/555411543532089/devices/bbbbbbbb-cccc-2000-dddd-43a8eabcdaa0 404 - 1
GET /app1/secure/pkg_e/v3/555412465246556/sessions 200 947 40
GET /app1/public/pkg_e/v3/555416264256223/account/stats 401 954 4
GET /app2/provisioning/v3/555412562561928/devices 200 1643 65
...

如果我想找出最常用的URL(以及方法和重新编码) – 我会这样做:

[root@srv112:~]$N=6;cat test|awk '{print $1" "$2" ("$3")"}'\
|sed 's/[0-9a-f-]\+ (/%GUID% (/;s/\/[0-9]\{4,\}\//\/%USERNAME%\//'\
|sort|uniq -c|sort -rn|head -$N
      4 GET /app1/public/pkg_e/v3/%USERNAME%/account/stats (401)
      2 GET /app1/secure/pkg_e/v3/%USERNAME%/devices (200)
      2 GET /app1/public/pkg_e/v3/%USERNAME%/account/stats (200)
      2 DELETE /app1/internal/pkg_e/v3/accounts/%USERNAME%/devices/%GUID% (404)
      1 POST /app2/servlet/handler (200)
      1 POST /app1/servlet/handler (200)

如果我想从同一个文件中找出最频繁的用户名 – 我会这样做:

[root@srv112:~]$N=4;cat test|grep -Po '(?<=\/)[0-9]{4,}(?=\/)'\
|sort|uniq -c|sort -rn|head -$N
      9 555412562561928
      2 555411543532089
      1 555417257243373
      1 555416264256223

以上在小型数据集上工作得很好,但是对于更大的输入集 – sort | uniq -c | sort -rn | head – $N的性能(复杂性)是难以忍受的(谈论~100台服务器,~250每台服务器的日志文件,每个日志文件约1mln行)

尝试解决:| sort | uniq -c部件可以很容易地用awk 1-liner替换,将其转换为:

|awk '{S[$0]+=1}END{for(i in S)print S[i]"\t"i}'|sort -rn|head -$N

但我没有找到标准/简单和内存效率高的“快速选择算法”(讨论here)来优化| sort -rn | head – $N部分.
正在寻找GNU二进制文件,rpms,awk 1-liners或一些易于编译的Ansi C代码,我可以携带/传播到数据中心,转向:

3   tasty oranges
225 magic balls
17  happy dolls
15  misty clouds
93  juicy melons
55  rusty ideas
...

进(给定N = 3):

225 magic balls
93  juicy melons
55  rusty ideas

我可能可以获取示例Java代码并将其移植到上面的stdin格式(顺便说一下 – 对核心java中缺少.quickselect(…)感到惊讶) – 但是在任何地方部署java-runtime的需求并不吸引人.
我也许可以抓取它的样本(基于数组)的C片段,然后将其调整到上面的stdin格式,然后测试和修复泄漏等等一段时间.或者甚至在awk中从头开始实现它.
但是(!) – 超过1%的人经常会遇到这种简单的需求 – 那里应该有一个标准的(预先测试过的)实现吗?
希望…也许我使用错误的关键词来查找它…

其他障碍:还面临一些问题需要解决大数据集:

>日志文件位于NFS安装的约100台服务器卷上 – 所以它
将工作并行化并分成更小的块是有意义的
>上面的awk'{S [$0] = 1} …需要记忆 – 我看到它死了
每当它吃掉16GB(尽管有48GB的空闲RAM和
大量的交换…也许我忽略了一些linux限制)

我目前的解决方案仍然不可靠,并且不是最佳(正在进行中),如下所示:

find /logs/mount/srv*/tomcat/2013-09-24/ -type f -name "*_22:*"|\ 
# TODO: reorder 'find' output to round-robin through srv1 srv2 ...
#       to help 'parallel' work with multiple servers at once
parallel -P20 $"zgrep -Po '[my pattern-grep regexp]' {}\
|awk '{S[\$0]+=1}
END{for(i in S)if(S[i]>4)print \"count: \"S[i]\"\\n\"i}'"
# I throw away patterns met less than 5 times per log file
# in hope those won't pop on top of result list anyway - bogus
# but helps to address 16GB-mem problem for 'awk' below
awk '{if("count:"==$1){C=$2}else{S[$0]+=C}}
END{for(i in S)if(S[i]>99)print S[i]"\t"i}'|\
# I also skip all patterns which are met less than 100 times
# the hope that these won't be on top of the list is quite reliable
sort -rn|head -$N
# above line is the inefficient one I strive to address
最佳答案
我不确定你是否可以编写自己的小工具,但你可以轻松编写一个小工具来替换| sort | uniq -c | sort -rn | head – $N-part with | sort | quickselect $N.该工具的好处是,它只能逐行读取第一个排序的输出,并且不会在内存中保留太多数据.实际上,只需要内存来保存当前行和前N行,然后打印.

这是源quickselect.cpp:

#include 

编译:

g++ -O3 quickselect.cpp -o quickselect

是的,我确实意识到你要求开箱即用的解决方案,但我不知道任何同样有效的方法.以上是如此简单,几乎没有任何错误的余地(假设您没有弄乱单个数字命令行参数:)

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